Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FZD3Q9NPG1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms