Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms