Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF3Q9H094 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms