Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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