Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NYXQ9GZU5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NYXQ9GZU5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms