Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ASXL3Q9C0F0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms