Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXQ1Q9C009 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
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FOXQ1Q9C009 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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FOXQ1Q9C009 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXQ1Q9C009 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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