Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCAPERQ9BY12 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCAPERQ9BY12 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms