Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms