Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIOK2Q9BVS4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms