Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDHD3Q9BSH5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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