Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC39A3Q9BRY0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms