Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LARP6Q9BRS8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms