Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms