Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MYD88Q99836 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms