Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF607Q96SK3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms