Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EP400Q96L91 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EP400Q96L91 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms