Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC136Q96JN2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC136Q96JN2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms