Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRIQ1Q96JM4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms