Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHAMP1Q96JM3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHAMP1Q96JM3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms