Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A3Q96HJ5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms