Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL22A1Q8NFW1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL22A1Q8NFW1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL22A1Q8NFW1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms