Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSIP1Q8NA03 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSIP1Q8NA03 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.6 ms