Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERC6Q8IVU3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC6Q8IVU3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms