Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms