Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP54Q7Z3B4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms