Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC80Q76M96 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms