Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM5Q71RC9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM5Q71RC9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms