Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR3Q6ZT12 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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