Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFXL1Q6ZNB6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms