Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms