Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms