Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms