Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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FAM78BQ5VT40 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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FAM78BQ5VT40 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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FAM78BQ5VT40 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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FAM78BQ5VT40 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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FAM78BQ5VT40 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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