Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARFGEF3Q5TH69 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms