Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms