Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A3Q5K4L6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms