Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF628Q5EBL2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF628Q5EBL2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms