Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms