Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP28Q4G0W2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms