Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SLFNL1Q499Z3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFNL1Q499Z3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms