Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TWISTNBQ3B726 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms