Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPHKAPQ2M3C7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPHKAPQ2M3C7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
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