Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RTN1Q16799 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RTN1Q16799 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms