Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SGCAQ16586 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SGCAQ16586 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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