Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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