Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC85BQ15834 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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