Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SYCP1Q15431 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms