Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms