Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms